亚鱼村历史悠久,属侗族聚居区,其名由来可追溯至明清时期,因当地曾有捕鱼为生的村落族群,"亚鱼"谐音"雅鱼",后逐渐演变为现名。明清时期,亚鱼村属思州府管辖,是湘黔边界商贸往来的重要驿站。
民国时期,亚鱼村归玉屏县管辖,村内保留有多处明清时期的木质结构民居、古驿道遗迹。新中国成立后,亚鱼村历经土地改革、人民公社、改革开放等阶段,逐步从传统农业村落发展为兼具农业、乡村旅游的新型村落。
近年来,亚鱼村依托侗族文化和自然生态优势,修缮了侗族鼓楼、风雨桥等特色建筑,保护和传承了侗族大歌、傩戏等非物质文化遗产,成为玉屏侗族文化展示的重要窗口。